Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCHIP1Q9P0W5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms