Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms