Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms