Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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