Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAGR1Q9BTK6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms