Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms