Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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USP9XQ93008 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP9XQ93008 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP9XQ93008 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP9XQ93008 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP9XQ93008 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP9XQ93008 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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USP9XQ93008 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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USP9XQ93008 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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USP9XQ93008 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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USP9XQ93008 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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USP9XQ93008 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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USP9XQ93008 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USP9XQ93008 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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