Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms