Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD1Q8NHV4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms