Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC112Q8NEF3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC112Q8NEF3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms