Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
C16orf54Q6UWD8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms