Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED27Q6P2C8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms