Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C4orf17Q53FE4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C4orf17Q53FE4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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C4orf17Q53FE4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C4orf17Q53FE4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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