Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSPP1Q1MSJ5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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