Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RTL8BQ17RB0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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