Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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