Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC6Q16204 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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