Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BRD3Q15059 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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