Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCAPHQ15003 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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NCAPHQ15003 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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