Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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