Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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