Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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