Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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