Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIAQ12857 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms