Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms