Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2BP67870 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2BP67870 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms