Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMC1P62191 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms