Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms