Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms