Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJC1P36383 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms