Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CXCR5P32302 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms