Protein–RNA interactions for Protein: P28324

ELK4, ETS domain-containing protein Elk-4, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK4P28324 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK4P28324 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK4P28324 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK4P28324 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK4P28324 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK4P28324 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK4P28324 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK4P28324 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK4P28324 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK4P28324 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK4P28324 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELK4P28324 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms