Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD27P26842 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CD27P26842 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD27P26842 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD27P26842 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD27P26842 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD27P26842 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD27P26842 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD27P26842 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD27P26842 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms