Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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APCP25054 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
APCP25054 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
APCP25054 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
APCP25054 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
APCP25054 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
APCP25054 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
APCP25054 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCP25054 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCP25054 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APCP25054 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCP25054 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCP25054 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCP25054 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCP25054 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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APCP25054 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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APCP25054 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCP25054 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCP25054 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APCP25054 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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APCP25054 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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APCP25054 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APCP25054 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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APCP25054 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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APCP25054 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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APCP25054 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APCP25054 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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