Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms