Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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C4orf47A7E2U8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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C4orf47A7E2U8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf47A7E2U8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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