Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAK1Q9UPV9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms