Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MID2Q9UJV3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms