Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms