Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms