Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNAL1Q9UBT7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms