Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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