Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms