Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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