Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGMNQ99538 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms