Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCF12Q99081 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms