Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms