Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF248Q8NDW4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF248Q8NDW4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF248Q8NDW4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF248Q8NDW4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF248Q8NDW4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF248Q8NDW4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF248Q8NDW4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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