Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRMPD1Q5SYB0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms