Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KRTAP27-1Q3LI81 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms